期刊简介
1987年10月创刊，中国科学技术协会主管，中华医学会主办。本刊是医学病毒学专业学术期刊，报道医学病毒学的应用及基础理论研究，人类病毒性疾病预防。栏目：述评、人物述林、病毒学、医学微生物学、传染病学、流行病学、儿科学、免疫学、肿瘤学、分子生物学临床免疫、病毒检测、医药信息等。读者为本专业科研人员、老年医学等学科的科技工作者，从事医学病毒学研究的科研人员；高、中等医药院校的有关教学人员；病毒性传染病的临床医师；生物制品工作者；各级卫生防疫工作者；临床检验工作者，以及与人畜共患病毒性疾病防治有关的基层工作者。 80页，单价16元。统一刊号CN11-2866/R,邮发代号18-224。
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首页>中华实验和临床病毒学杂志
- 杂志名称：中华实验和临床病毒学杂志
- 主管单位：实验和临床病毒学杂志
- 主办单位：中国科学技术协会
- 国际刊号：11-2866/R
- 国内刊号：11-2866/R
- 出版周期：双月刊
期刊荣誉：中国科协优秀科技期刊二等奖期刊收录：统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 万方收录(中), 文摘与引文数据库, 知网收录(中), 剑桥科学文摘, CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), CA 化学文摘(美), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日)
应用高通量测序技术快速鉴定未分型甲型流感病毒
茅海燕；孙逸；楼秀玉；颜浩；程伟；姚文武；王欣莹；潘军航；张严峻
关键词：甲型流感病毒, 亚型, 高通量测序, 快速鉴定
摘要：目的 利用Ion Torrent半导体二代测序技术开展禽类和外环境中禽流感病毒基因组测序和亚型的快速鉴定,建立快速鉴定未分型甲型流感病毒亚型的高通量测序方法.方法 提取9份禽类拭子和外环境标本中的病毒RNA,进行甲型流感病毒通用型、H5N1亚型、H7N9亚型和H9N2亚型荧光定量PCR检测;利用PathAmpFluA试剂盒对病毒RNA进行全基因组扩增,利用Next Fast DNA Fragmentation & Library Prep Set for Ion Torrent试剂盒进行文库制备,并在Ion torrent二代测序仪上完成测序;采用Ion Torrent Suite v3.0进行测序数据提取和质量评估,并且用FluAtyping v4.0和PathogenAnalyzer两个插件进行流感序列拼接和数据库比对,终确定9份禽流感标本的流感病毒亚型.结果 9份禽类拭子和外环境标本甲型流感病毒核酸阳性但常规监测的H5N1、H7N9和H9N2亚型均为阴性,经二代测序和生物信息学分析共鉴定出7种亚型:H2N3、H5N6、H5N8、H7N1、H7N7、H11N3亚型流感病毒阳性标本各1个,H6N6亚型流感病毒阳性标本3个.结论 浙江省外环境中禽流感病毒亚型众多,Ion torrent半导体测序技术适用于禽及外环境监测中发现的未分型甲型流感病毒亚型的快速鉴定.
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