期刊简介

1987年10月创刊,中国科学技术协会主管,中华医学会主办。本刊是医学病毒学专业学术期刊,报道医学病毒学的应用及基础理论研究,人类病毒性疾病预防。栏目:述评、人物述林、病毒学、医学微生物学、传染病学、流行病学、儿科学、免疫学、肿瘤学、分子生物学临床免疫、病毒检测、医药信息等。读者为本专业科研人员、老年医学等学科的科技工作者,从事医学病毒学研究的科研人员;高、中等医药院校的有关教学人员;病毒性传染病的临床医师;生物制品工作者;各级卫生防疫工作者;临床检验工作者,以及与人畜共患病毒性疾病防治有关的基层工作者。 80页,单价16元。统一刊号CN11-2866/R,邮发代号18-224。

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  • 杂志名称:中华实验和临床病毒学杂志
  • 主管单位:实验和临床病毒学杂志
  • 主办单位:中国科学技术协会
  • 国际刊号:11-2866/R
  • 国内刊号:11-2866/R
  • 出版周期:双月刊
期刊荣誉:中国科协优秀科技期刊二等奖期刊收录:统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 万方收录(中), 文摘与引文数据库, 知网收录(中), 剑桥科学文摘, CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), CA 化学文摘(美), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日)
中华实验和临床病毒学杂志2018年第05期

肠道病毒5'-非翻译区测序分型的应用评估

唐诗欢;谢争华;刘朵朵;袁颖;陈满君;范笑地;丁细霞;余楠

关键词:肠道病毒, 5'-非翻译区, 逆转录·聚合酶链式反应, 测序, 分型
摘要:目的 评估5’-非翻译区(5’-untranslated region,5’-UTR)扩增测序法对临床标本直接进行肠道病毒(enterovirus,EV)血清型分型的价值.方法 收集实时荧光聚合酶链反应(real-time PCR)检测EV通用型核酸为阳性的肛拭518份、鼻拭148份,采用5’-UTR区逆转录PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)对标本中的EV进行扩增、测序、比对及血清型分型,与VP1(viral protein 1)区简并引物巢式PCR测序分型方法比较,两者不一致的标本经EV血清型特异性RT-PCR验证.结果 666份EV通用型核酸为阳性的标本,5’-UTR和VP1区各分型成功553例(83.0%)和318例(47.7%),P<0.001;以VP1法为参考,对肛拭中主要检出的血清型CoxA6(217例)、CoxA 16(88例)、EVA71(40例)、CoxA10(28例)和CoxA4(27例),5’-UTR法敏感度(57.1%~100%)、特异度(67.4%~98.1%)以及方法一致性(kappa值0.188 ~0.847),均因血清型而异;对鼻拭中主要检出的血清型EVD68(15例),5’-UTR法敏感度100%,特异度91.1%,一致性差(kappa值0.217).分型不一致标本,经CoxA6、CoxA 16、EVA71、CoxA10和EVD68型特异性RT-PCR验证,大部分得以确认.以VP1法联合型特异性RT-PCR法为参考,5’-UTR法的敏感度和特异性以及与参考方法的一致性均提高.结论 5’-UTR对肠道病毒的分型的敏感度和特异度因血清型而异,应用时应根据研究目的综合考虑.