期刊简介
1987年10月创刊，中国科学技术协会主管，中华医学会主办。本刊是医学病毒学专业学术期刊，报道医学病毒学的应用及基础理论研究，人类病毒性疾病预防。栏目：述评、人物述林、病毒学、医学微生物学、传染病学、流行病学、儿科学、免疫学、肿瘤学、分子生物学临床免疫、病毒检测、医药信息等。读者为本专业科研人员、老年医学等学科的科技工作者，从事医学病毒学研究的科研人员；高、中等医药院校的有关教学人员；病毒性传染病的临床医师；生物制品工作者；各级卫生防疫工作者；临床检验工作者，以及与人畜共患病毒性疾病防治有关的基层工作者。 80页，单价16元。统一刊号CN11-2866/R,邮发代号18-224。
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首页>中华实验和临床病毒学杂志
- 杂志名称：中华实验和临床病毒学杂志
- 主管单位：实验和临床病毒学杂志
- 主办单位：中国科学技术协会
- 国际刊号：11-2866/R
- 国内刊号：11-2866/R
- 出版周期：双月刊
期刊荣誉：中国科协优秀科技期刊二等奖期刊收录：统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 万方收录(中), 文摘与引文数据库, 知网收录(中), 剑桥科学文摘, CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), CA 化学文摘(美), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日)
诺如病毒河北卢龙株NHBGR59全基因组序列分析
敖元云；虞结梅；李莉莉；靳淼；段招军
关键词：诺如病毒, GⅡ.6型, 进化树, 基因组
摘要：目的 分析河北卢龙县腹泻儿童粪便标本中存在的诺如病毒株NHBGR59的全基因组序列,了解其基因结构特点和进化特征.方法 根据454高通量测序获得的两个重叠群(contig)和诺如病毒参考株序列(GenBank登录号KM198534)设计NHBGR59特异性引物,用重叠反转录聚合酶链反应(Reverse transcription PCR,RT-PCR)和cDNA末端快速扩增的技术(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)的方法扩增其全长基因,经过分子克隆、测序获得全基因组序列,然后进行三个开放阅读框(Open Reading Frames,ORFs)序列和系统进化树的分析.结果 诺如病毒河北卢龙珠HBGR59病毒全基因组全长为7 563 bp(除了PolyA尾),病毒基因组分为三个ORFs:ORF1(5～5 098 nt)、ORF2(5 079 ～6 731 nt)和ORF3(6 731 ～7 510 nt),其中ORF1和ORF2之间有20 bp重叠,ORF2和ORF3之间有1 bp重叠.经过全基因组序列分析发现其和基因组Ⅱ基因型6(genogroup Ⅱ GenotypeV,GⅡ.6)诺如病毒株30443同源性高(同源性为98.0％).ORF2以及ORF3核苷酸和氨基酸序列与株30443同源性高(分别为97.0％,98.0％;99.0％,98.0％).ORF1的基因和氨基酸序列与台湾暴发的急性胃肠炎GⅡ.6株11-F J-5(GenBank号KM461694)同源性高(99.0％,99.3％),只在高突变P2区发生一个氨基酸突变位点:aa308 D→N;其中衣壳区的氨基酸序列与其他GⅡ.6型诺如病毒相似度为73.0％ ～99.3％.进化树分析发现河北卢龙株HBGR59与GⅡ.6型株30443和11-FJ-5亲缘关系近.结论 河北卢龙株HBGR59为诺如病毒GⅡ.6型,进化关系上与已报道的GⅡ.6型株30443和1l-FJ-5近.
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